分子重排反應(molecular rearrangement reaction)是分子中的一個基因或原子從一個原子轉移到另一個原子上，形成一個新的分子的反應。分子重排可分為分子間重排和分子內重排。在重排中，遷移原子或者基團完全游離并脫離原來的分子，然后與其它部分連接，這種重排稱為分子間重排。在這種重排中，遷移基團也可能來自不同分子。而分子內部重排則與其它分子無關，遷移基團始終沒有脫離原來的分子，僅從分子的一部分遷移至另分子的另一部分。重排是一種復雜的有機化學現象。在有機合成中，一些重排經常是所需反應的競爭反應，合成中應加以避免，一些重排可提供巧妙的合成途徑，應盡量加以利用。重排反應有多種類型，這里僅介紹一些酸催化重排反應。